附睾肿大且伴有疼痛，往往考虑急性附睾炎，在治疗上先要求患者卧床休息，托起阴囊可以减轻疼痛，早期用冰袋冷敷，避免性生活，后期可以热敷，抗生素治疗是治疗急性附睾炎的主要药物，经验性的推荐头孢类抗生素，静脉点滴，加大环内酯类或喹诺酮类抗生素口服，根据培养结果选择敏感抗生素。
一般是静脉给药1-2周后，再口服抗菌药物2-4周，止痛的药物可以选择口服镇痛药物，必要的时候利多卡因精索封闭缓解疼痛，非甾体抗炎药物对治疗急性附睾睾丸炎也有一定的帮助，中药可以改善微循环，减少附睾纤维组织生成，缩短病程，多数急性附睾睾丸炎经过及时有效的治疗可以治愈，应用抗生素也可以使绝大多数的患者疼痛肿胀症状缓解，但少数患者疼痛会持续一段时间，有的时候附睾肿大消退以后，可以在附睾上留下一个小的结节，但对人体没有太多的影响。