肠道菌群失调与全身的疾病，尤其是胃肠道疾病有很多相关性。目前还没有定论它的具体症状有哪些，只能说会影响到肠道功能的方方面面，可能和很多消化道的症状都有一定的相关性，包括腹痛、腹泻，包括幽门螺旋杆菌、脂肪肝，包括全身性的疾病：糖尿病、代谢综合征，甚至目前认为它与心脏病、高血压、肥胖症都有一定的相关性。