恶性疟疾的治疗包括以下几个方面：
第一、针对病原治疗，可以选择氯喹，如果氯喹耐药可以应用青蒿琥酯、奎宁联合多西环素或者联合克林霉素，一般不需要加用伯氨喹，因为恶性疟疾不存在肝内迟发型子孢子，具体的选择用药和治疗疗程，需要遵照医生的医嘱。
第二、对症处理，如果患者有高热，通常可以应用药物来降温，常用包括对乙酰氨基酚或者布洛芬。如果是脑型疟疾需要应用脱水治疗，可以应用甘露醇、速尿或者甘油果糖。
第三、如果患者出现了肾脏的损伤，出现了急性肾损害、少尿，必要的时候还需要进行肾透析治疗。