肾脓肿可由上行感染、血源性感染、周围组织感染直接蔓延或淋巴感染导致，致病菌以革兰阴性菌为主，也可见于球菌、杆菌等其他菌属。好发于糖尿病、免疫力低下、长期留置导尿管等等人群。输尿管或肾结石、输尿管畸形或狭窄梗阻、肾盂肾炎、肾结核等疾病均可诱发。