雌二醇低不一定是卵巢早衰，而且在月经周期的不同时段，雌二醇的水平不一定，雌二醇只有在排卵期前或者月经前会有一个小高峰。在来月经的时候查性激素，通常雌二醇水平不会很高，一般处于一个比较低的水平，这是正常情况。判断卵巢早衰，主要是从促卵泡激素，也就是FSH的水平来判断。卵巢早衰的诊断是需要年龄小于40岁，有停经史，比如六个月不来月经或者跟她的月经周期相比三个周期没有来。再就是促卵泡激素，隔12周，也就是三个月以后两次检查都是大于40，同时年龄小于40岁，就可以诊断卵巢早衰。
单纯的雌二醇低不能诊断卵巢早衰。而对于卵巢早衰来讲，首先要看目前有没有症状，然后要用雌孕激素补充，主要的目的是缓解目前的不适症状，预防远期有可能出现的骨质疏松、心血管疾病的风险，甚至于老年痴呆的风险，要降低这些风险。