跟川崎病相似的疾病，相对来说，在儿童中有几类比较相似，主要包括以下两种：
1、急性感染：尤其是急性链球菌感染，也会表现为发热、草莓舌、身上有皮疹、颈部淋巴结肿大、口唇皲裂，这些跟川崎病都很相似。但是用抗生素以后，白细胞会降下来，体温的症状会有所好转，而且不会出现冠状动脉的病变，这是和川崎病区别的主要几点，急性链球菌感染跟川崎病其实是最容易混淆的一类疾病。
2、幼年型类风湿关节炎：有发热、皮疹、淋巴结肿大、白细胞和血沉的增加，可是它往往也没有冠状动脉的病变，往往要用激素才有效，而川崎病一般使用丙种球蛋白，这是这两个疾病的区别要点。
总之，和川崎病比较相似儿童的疾病，最多见的一个是急性链球菌感染，另一个是幼年型类风湿关节炎。