细菌和病毒感染都可以引起C反应蛋白的升高，一般细菌的感染C反应蛋白升高的比较显著，多数会在50-60以上，可以升高到200左右的水平。对于病毒的感染，C反应蛋白轻度升高，多数是在50-60以下。C反应蛋白一般是在起病后六个小时才开始升高，如果在早期C反应蛋白处于上升的阶段，这时很难区分病毒和细菌。
所以，单凭C反应蛋白这一个指标没办法鉴别细菌还是病毒，还要结合血常规的检测。如果血常规的检测结果白细胞升高，同时伴有粒细胞升高，再结合C反应蛋白升高，可以帮助诊断细菌感染。病毒感染、白细胞水平一般不高，而且中性粒细胞比例也正常，多见于淋巴细胞升高，或者淋巴细胞的下降。只有把血常规和C反应蛋白两者结合起来，才能够准确的判断细菌还是病毒。