伤寒初期的确诊需要依靠血培养，血培养如果能够培养出伤寒杆菌，就可以确定伤寒杆菌的感染。一般在发病的病程，第1-2周这个期间血培养的阳性率比较高，可以高达80%-90%。如果随着时间的推移，在后期血培养的阳性率就会逐渐下降。
在第三周末血培养的阳性率仅有50%，以后随着时间的推移阳性率会越来越低。如果在伤寒初期，已经应用了抗菌药物的治疗，血培养的阳性率就会明显的下降。这时可以选择骨髓培养，骨髓培养的阳性率不受抗生素药物的影响，所以可以帮助患者在早期或者后期确定伤寒。