磁共振检查都是按照部位收费，当前磁共振的临床应用越来越好广，但磁共振扫描费时，一般不用于急诊检查。对一些含气组织比如肺部和胃肠道的检查作用有限，而且磁共振检查费用昂贵，不作为常规检查项目，都是根据需要选择检查部位。磁共振可以检查颅内疾病，特别是鞍区、后颅窝和脊髓病变有优势；可以直接显示心脏大血管，观察其形态学和血流动力学变化；可以显示骨关节和肌肉系统疾病；可以诊断纵隔、腹部和盆腔疾病；可以进行平扫和增强扫描。磁共振检查不同部位、不同检查方法、不同设备、不同地区及不同级别医院收费标准不同。一般一个部位平扫需要600-800元，增强扫描1000-2000元。