肛瘘症状表现为初起肛门肿痛不适，随后出现破溃、流出黄白色稠状脓液、肿痛缓解。饮酒及进食辛辣食物刺激后，可再次引起肛周肿块隆起伴疼痛流脓的症状，内裤常有分泌物、有异味，容易反复发作。长期流脓的肛瘘患者疼痛不明显，但会刺激肛周皮肤引起肛周潮湿、瘙痒，给生活带来不便。检查可触及肛旁有肿块，疼痛发作时肿块增大，缓解期则缩小不能完全消失。