三叉神经痛依据病因分为原发性和继发性三叉神经痛，原发性三叉神经痛的病因目前为止尚未完全明确，认为三叉神经在脑桥被异行扭曲的血管压迫三叉神经后根，导致三叉神经后根局部产生脱髓鞘变化，从而引起疼痛发作。继发性三叉神经痛多有明确的病因，如颅底或桥小脑角的肿瘤、转移瘤、脑膜炎、脑干梗死、多发性硬化等。这些疾病可侵犯三叉神经的感觉根或髓内感觉核而引起三叉神经痛，继发性三叉神经痛多数伴有邻近结构的损害和三叉神经本身的功能缺失。