不来月经大多数是因为内分泌失调引起，内分泌失调就是指的HPO轴功能异常。下丘脑或者垂体等中枢出现问题会导致闭经，比如因为节食、减肥或者大运动量导致的闭经，或者是席汉综合征，表现出低促性腺激素性闭经，促卵泡素、促黄体素以及雌孕激素水平都缺乏，这种情况就需要补充雌孕激素调经。
还有多囊卵巢综合征，就是不排卵或者稀发排卵导致不来月经、不排卵，所以孕激素水平缺乏可以用孕激素调经。还有高促性腺激素性闭经，也就是卵巢功能不好，FSH和LH水平高，但是雌激素水平低，需要补充雌孕激素治疗。