先天性胆道闭锁的并发症有生长发育迟缓、出血、肝硬化、肝功能衰竭等。
1、生长发育迟缓：由于胆道闭锁，胆汁不能顺利的到达肠道以帮助消化饮食中的脂肪，会导致消化吸收障碍，出现生长发育迟缓。
2、出血：肝脏损伤会导致缺乏蛋白质和缺乏维生素，凝血功能障碍，导致皮肤瘀斑，上消化道出血等。
3、肝硬化：胆汁无法正常排出可导致胆汁淤积性肝硬化。
4、肝功能衰竭：是胆道闭锁最严重的并发症，也是胆道闭锁致死的主要原因。