小儿先天性心脏病房间隔缺损，如果缺损非常小，可以不影响宝宝的发育，在四岁以前有一小部分孩子有自然闭合的可能性，但是房间隔缺损比较大时，左向右分流量较大，会产生肺循环充血以及肺动脉高压，影响宝宝的生长发育。一般继发孔型房间隔缺损，在儿童时期能较好地被耐受，通常到20岁左右才有症状，可以出现肺动脉高压、房性心律失常、二尖瓣或三尖瓣关闭不全，严重者还可以出现充血性心力衰竭，感染性心内膜炎等。
如果是房间隔缺损的患儿症状较明显，应早期施行手术治疗。如果是症状比较轻或没有临床症状，但是有血流动力学改变的，可以在2-6岁进行手术修补治疗，一部分患儿也可以通过心导管，通过介入手术进行封堵治疗。