精子畸形率过高会导致男性不育，因此，应当积极预防和治疗。首先，要消除不良生活方式和环境带来的影响，像是戒烟戒酒，避免近期接触放射线、辐射、有毒有污染的环境，避免服用激素或某些化学药品。其次，应当针对病因进行治疗。比如预防和治疗生殖道感染、内分泌治疗、精索静脉曲张的治疗。经过上述治疗效果不理想的畸形精子症，可采用夫精授精或辅助生殖技术即试管婴儿助孕。