肝内胆管细胞癌的症状并不是非常特异，很多病人起始的症状就是上腹部不适；它的定位也并不是非常的准确，有些病人可能会放射到腰背部，甚至到肩背部都有可能。另外常见的症状就是黄疸。黄疸主要表现为全身皮肤的黄染、眼睛巩膜黄染、小便黄染。如果黄疸严重，出现像浓茶一样的小便。除此之外还有非特异性的消化道症状，像恶心、呕吐、食欲减退等。患者可能还会出现乏力、消瘦等症状。