胆管癌晚期如果失去手术机会，通过全面评估患者各个脏器功能可以耐受静脉化疗，则首选静脉化疗，静脉化疗的药物选择建议首选吉西他滨加顺铂。如果患者经过全面评估后判断不适合静脉化疗，则考虑可以口服化疗药物，可以选择口服卡培他滨或替吉奥治疗。
如果患者经过判断没有接受化疗的可能，也就是耐受不了化疗，那么可以尝试口服阿帕替尼或者安罗替尼治疗。如果患者由于经济原因，阿帕替尼和安罗替尼都无法接受，那么可以尝试口服一些中药，如鸦胆子油胶囊，以及可以口服保肝药从而抑制胆管癌引起的肝脏功能受损。