做肠镜一般是不会出现交叉感染的。虽然内镜检查每个病人有可能使用同一条内镜，但是这条内镜在完成一例检查之后要经过非常严格的消毒，要经过搓洗、漂洗、酶洗、消毒、干燥等多个程序，一般经过这些处理以后常见的致病菌是完全可以杀灭的，所以在临床上做肠镜不要担心有交叉感染情况的出现。以上内容仅供参考，具体用药、治疗请以医生面诊为准。