甲亢肝功能损害主要有三个方面的原因：一、甲亢本身可以导致轻微的肝功能损害；二、甲亢药物导致的肝功能损害；三、甲亢合并其他肝病导致肝功能损害。如果是甲亢本身引起的肝功能损害，可以给予抗甲亢药物治疗或者碘131治疗，随着甲状腺功能恢复正常，肝功能一般会逐渐恢复正常。如果是合并了其他肝病，应该采用碘131治疗。如果是抗甲亢药物导致的肝功能损害，应该立即停止抗甲亢药物，改为碘131治疗；个别患者需要行手术治疗才能把甲亢治愈。