小儿半乳糖血症主要或常见病因包括半乳糖代谢酶的缺乏，从而使血液中的半乳糖浓度升高。主要涉及半乳糖-1-磷酸尿苷酰转移酶、半乳糖激酶、尿苷二磷酸半乳糖-4-异构酶三种乳糖代谢酶。
1、半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶缺乏：半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶的主要功能是把半乳糖-1-磷酸转化为尿苷二磷酸半乳糖酶，因此它的缺失会引起尿苷二磷酸半乳糖酶的缺失，导致血液中半乳糖的转化障碍。
2、半乳糖激酶缺乏：半乳糖激酶是半乳糖代谢中的第一种酶，主要作用使半乳糖转化为半乳糖-1-磷酸，它的缺失使半乳糖-1-磷酸生成障碍，引起半乳糖的积累。
3、尿二苷酸半乳糖4异构酶缺乏：主要作用使尿二苷磷酸半乳糖-4转化为尿二苷磷酸葡萄糖，因此，此酶的缺失会引起半乳糖转化受累、葡萄糖生成障碍。