对于早期的附睾结核，一般不需要手术治疗，而是通过足程、足量的抗结核药物抗结核治疗，常用的药物有异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇等。在使用这些药物的过程中，需要定期复查肝肾功能。一般较小的附睾结核结节可以完全消退，对于附睾结核病变较大，坏死严重，有脓肿或窦道形成或经过药物保守治疗无效者，可以行切开引流手术或附睾切除手术。如果病变累及睾丸，则可与睾丸一并切除，如果累及阴囊则可切除部分阴囊组织。