对于肠息肉的治疗方法，根据肿物的大小、部位以及具体的性质来决定。如果息肉相对较小，在2cm以下，基底相对较窄，大多数情况都可以在肠镜下将息肉切除。如果息肉较大，只有将部分肠管一并切除，才能治愈因息肉引起的一切表现。
由于有些息肉是癌前病变甚至是恶性的肿物，在明确诊断以后常常还需要进行局部的扩大切除，肠镜切除息肉可以很好的减轻患者的手术负担，并且在切除息肉以后，很多的恶性倾向息肉可以得到根治的效果，因此肠镜是诊断和治疗肠息肉的最重要手段。