激光笔照到眼睛，轻者会出现视网膜凝固、水肿的灰白色损伤斑，病程为1-2周，水肿消退，严重的患者则会出现视网膜灼伤、裂孔、出血，病程为3-4周，出血吸收后会留有色素沉着，并形成瘢痕。病变范围涉及到黄斑区，视力会严重下降，有一部分人视力会下降到0.1以下。
眼睛是人体对激光最敏感的器官，由于激光的特性，能使能量在空间和时间上高度集中，眼睛的晶状体有聚焦的作用，会使视网膜在单位面积上所受激光照射的能量，比相应的角膜入射量高近10万倍，激光单色性好、很强，在眼底的色差极小，因为脉冲激光致伤，会比眼睛的眨眼反射要快得多，再加上极端的瞬间，在极小的面积上能量的集中释放，即使是低剂量的激光照射，也可以导致眼角膜，或视网膜严重损伤。