泌尿系统疾病包括泌尿系结石，如肾结石、输尿管结石、膀胱结石及尿道结石等。泌尿系疾病还有泌尿系感染，泌尿系感染分为非特异性感染和特异性感染。非特异性感染包括肾盂肾炎、膀胱炎及前列腺炎等，特异性感染是指膀胱结核、肾结核等。
泌尿系肿瘤包括肾癌、输尿管癌、膀胱癌、前列腺癌及尿道癌，男性病人还会有阴茎癌、龟头癌等，女性病人还会有外阴癌。泌尿系疾病还包括肾上腺疾病，由于肾上腺增生或肾上腺肿大形成的包块，常常包括肾上腺皮质癌、肾上腺嗜铬细胞瘤、肾上腺腺瘤、肾上腺醛固酮瘤等。