碎石后小结石会排出到输尿管，引起输尿管痉挛，导致比较强烈的肾绞痛，这个时候通常应用解痉、利尿的药物，大多数患者都可以得到缓解。
但如果疼痛比较剧烈，就需要应用强效的镇痛药，如杜冷丁、吗啡等，绝大多数患者都可以得到有效的缓解。但是如果遇到疼痛剧烈的患者，可以行DJ管置入术，置入后结石不能活动，这样的患者疼痛就可以得到缓解。
还有部分患者会合并感染，有时会引起肾盂肾炎，这个时候就需要合并应用抗生素治疗。