核磁共振可以用来进行子宫内膜异位症的相关检查，因为在临床上对于子宫内膜异位症分为盆腔型子宫内膜异位症，或者是卵巢型子宫内膜异位症，具体如下：
第一、盆腔型大多数都会引起较为严重的痛经，在进行妇科检查的时候，由于盆腔的最低点是在子宫直肠窝，俗称道格拉斯窝，因此当有子宫内膜异位的情况下，有很多都会异位在此处。异位在此处，随着时间的延长，伴随着每次月经周期都会有少量的出血。由于这样的出血并没有途径可以流出体外，所以会造成局部炎症的粘连，并且逐渐会形成比较严重的触痛结节。伴随着性生活、妇科检查、内诊触碰的时候，都会引起比较严重的疼痛，触摸的时候活动度不好，几乎是紧紧的粘连于道格拉斯窝内部。
第二、卵巢型子宫内膜异位症，这种就是俗称的巧克力囊肿，对于核磁共振检查此类疾病，优点在于可以从各个切面、各个层面，来判断一下软组织相互的关系，能够在核磁共振的影像学上清晰的、立体的预判断，在手术过程中能够出现病变的位置，因此对于术前的诊断以及手术中的探查，都能够起到很大的好处。