肥厚性心肌病晚期，主要症状是劳力性呼吸困难和心律失常，主要是改善症状，预防猝死，可以使用β受体阻滞剂，或非二氢吡啶类的钙通道阻滞剂，比如美托洛尔、地尔硫卓等，可以使心肌收缩率降低，减慢心率，降低猝死的发生几率。使用过程中出现心率明显下降可以停药，心律失常也是常见症状，可以使用胺碘酮预防猝死。如果单纯心尖肥厚，没有室间隔肥厚及流出道梗阻，可以适当应用RAAS系统抑制剂，含有普利类或沙坦类的药物，同时伴有严重心动过缓，可以进行心尖起搏治疗。如果经过上述治疗无效，心功能继续下降可以手术治疗，切除肥厚的心尖或者直接心脏移植。