甲状腺功能减退症最常见的临床表现，可以出现面色苍白、眼睑及颜面部水肿、表情淡漠，皮肤干燥、增厚、粗糙，毛发脱落、稀疏，还有些患者会有智力低下、记忆力减退、嗜睡、反应迟钝，严重者可以出现痴呆，还有些患者可以有心动过缓、血压低，严重的时候伴有心包积液和胸腔积液，重者可以发生黏液性、水肿性心肌病。
除了心血管系统以及神经精神系统表现之外，有些患者会有腹胀、便秘等消化系统症状，严重的时候可以出现肠梗阻或者缺铁性贫血。在患者病情严重的时候，由于受寒冷、感染、手术等不当的应激条件下，可以诱发黏液性水肿昏迷或者甲状腺危象，临床表现为低体温、呼吸减慢、心动过缓、血压下降，甚至发生昏迷、休克以及心肾功能衰竭，这就属于甲状腺功能减退比较严重的并发症。