脓毒血症的患者如果能够做到及时到医院就诊，早期作出诊断，尽早应用抗菌或抗病毒的药物，多数患者通过治疗可以治愈。
如果延误病情，脓毒血症进展比较快，可以引起多脏器的功能障碍，甚至引起脏器功能衰竭，严重的患者也可以出现脓毒症休克，导致全身有效的循环血容量下降，组织器官血流灌注不足，进一步可以引起缺氧、酸中毒，严重的可以出现DIC，甚至死亡，所以早期诊断脓毒血症，尽早应用有效的抗菌药物，或者抗病毒药物，是决定患者预后非常重要的因素。此外患者本身的机体免疫状态也决定了预后，如果患者有严重的基础疾病，以及长期应用免疫抑制剂、粒细胞缺乏等，导致免疫功能低下的情况，患者的预后相对来说比较差。