男性有乙肝小三阳一般对怀孕影响不大，对于婴儿感染乙肝，最主要的是在生产过程中，如果母亲没有乙肝，一般是不会影响胎儿的。对于男性有乙肝小三阳，性伴侣需要查乙肝五项指标，如果乙肝表面抗体阳性不需要担心，因为是不会感染乙肝的。
如果乙肝表面抗体是阴性的，是需要去打乙肝疫苗的，直到抗体产生为止。一部分男性可能会口服抗病毒药物，需要适当的注意，一般建议服用副作用比较小的药物，如恩替卡韦或替诺福韦，这样的药物是可以怀孕的。如果使用干扰素，对胎儿是有影响的，一般是不建议怀孕的。