对于前列腺结石患者，多数患者结石小而多，且无明显临床症状，常不需要治疗。对有症状而感染不严重的前列腺结石患者，可采用保守治疗，如进行前列腺按摩，以及其他对症治疗，并定期观察结石大小的变化。
对结石合并慢性前列腺炎等并发症者，以处理合并症为主，如予以抗生素、α1受体阻滞剂、M受体阻滞剂、植物制剂、非甾体类消炎镇痛药物、中医药等药物进行处理。
对于症状严重而需要手术治疗者，应根据结石的数目、大小、位置、患者年龄、全身一般状况，以及并发症状况，选择适当的手术方法进行治疗。