手足口病疫苗只打了一针也有用，手足口病疫苗主要是预防儿童感染EV71病毒引起的重症手足口病。儿童接种过手足口病疫苗以后，体内就会产生相应的保护性抗体。
手足口病疫苗要连续打两针，第一针和第二针相隔一个月左右，如果儿童的手足口病疫苗只是打了一针，体内也会有保护性的抗体，但是没有加强，体内保护性抗体的浓度相对偏低。
但是对于手足口病的重症预防有一定效果，只是预防的作用略差。