牙周炎分为急性的牙周炎和慢性牙周病，在急性的牙周炎的时候可以应用全身抗炎治疗，推荐使用头孢类的抗生素加上甲硝唑类的药物。
因为在牙周袋中，主要隐藏的是以厌氧菌为主的各种细菌混合感染，所以可以用对厌氧菌有效的药物甲硝唑，也可用其他细菌有效的药物，如头孢类的药物。临床上常用的头孢类的药物有头孢唑啉钠、头孢甲肟、头孢克肟、头孢曲松等等，甲硝唑类的药物常用的有甲硝唑、替硝唑、奥硝唑。
如果是慢性的牙周炎，一般不需要进行抗炎治疗。如果得了牙周炎，除了药物治疗以外，还应该到正规医院的口腔科或者是大型医院的牙周病科就诊，急性牙周炎需要进行牙周袋的冲洗，慢性的牙周病需要进行牙周治疗。