肝细胞癌的分级目前主要通过细胞形态、排列形式、核浆比、核分裂象等多个指标进行的。目前分为Ⅳ级，级别越低，说明癌细胞分化越好；级别越高，说明癌细胞分化越差。其中，Ⅰ级在病理上被认为是高分化型，Ⅱ级和Ⅲ级认为是中分化型，Ⅳ级被认为是低分化型。
在临床上可以根据肝细胞癌的分级，结合其他的病理检测，可以对肝癌的预后作出一定的判断。Ⅰ级主要是癌细胞形态与正常肝细胞相似，呈条索状排列，胞浆呈嗜酸性，细胞核大小规则，核分裂象非常少见；Ⅱ级主要是癌细胞形态轻度改变，呈条索状或者巢状排列，核浆比例明显增大，核分裂象增多。
Ⅲ级是指癌细胞明显变形，呈巢状排列，核浆比继续增大，细胞核大小不等，染色也不规则，核分裂象多见，有时可见巨癌细胞；Ⅳ级是指癌细胞呈明显的异型性，可见梭形细胞和多核巨细胞，胞浆少而核染色深，核分裂象多见，细胞排列紊乱。