早期合理的治疗，能使90%以上患儿的癫痫发作得到完全或大部控制。合理使用抗癫痫药物是当前治疗癫痫的主要手段。
一、病因治疗
小儿癫痫可以继发于脑肿瘤、脑炎、脑血管病和部分代谢性疾病等，治疗癫痫同时也要去除病因。
二、药物治疗
1、苯巴比妥：对各年龄段出现的强直阵挛发作、肌阵挛以及全身强直发作均有效，对简单部分发作及精神运动性发作效果良好，同时需定期查血药浓度。不良反应是常产生困倦、头昏并易激动，服药1～2周内能适应。
2、苯妥英钠：主治单纯部分性发作和全身强直一阵挛发作，对复杂部分性发作、强直性发作亦有效，口服、静脉注射可治疗癫痫持续状态。不良反应是长期服用可导致胃肠道不适、肝功异常、粒细胞及血小板减少、认知功能和记忆力下降，也可能出现低血钙及骨软化、不育症、阳痿、多毛症等。
3、卡马西平：主治部分性发作及强直阵挛发作，对简单部分发作尤其复杂部分性发作效果最好，作为首选药。不良反应常见的为头晕、困倦、视力模糊及复视，也可能出现平衡障碍、眩晕、眼震、共济失调及感觉过敏，同时皮疹多见，但不影响认知功能。
4、丙戊酸钠：对各型癫痫发作均有效，尤其失神发作为首选药物。对全身性强直阵挛发作也有很好的效果，可用于单纯部分性发作、复杂部分性发作、肌阵挛性发作、失张力发作及婴儿痉挛症的治疗。常见的不良反应为胃肠道功能障碍，包括食欲不振、恶心、呕吐、消化不良腹泻或便秘等。特别注意肝损害，故服用中要定期检查肝功能。
5、拉莫三嗪：拉莫三嗪是治疗局限性发作癫痫患儿疗效确切、安全性好、可单药使用的药物。但是该药物是会导致患者出现过敏反应，一旦出现症状，应该及时停药。
三、手术治疗
对于癫痫发作无法控制，有定位明确的可切除单侧局部病灶或皮质异常区，可进行外科手术治疗。常用手术方法为脑皮质病灶切除术、前颞叶切除术、大脑半球皮质切除术、癫痫的立体定位手术治疗。
癫痫病灶切除性手术：这种手术方法主要适用于致癫痫的病区和功能区定位明确,且切除致痫区不会损害患者的重要神经功能的患者。可以有效的缓解疾病症状，但是会导致患者出现术后并发症，例如神经功能缺陷,、偏瘫、颅内感染以及颅内血肿等。