女性生殖器疱疹在发病期间应该及时的使用抗病毒药物治疗，比如内服阿昔洛韦、伐昔洛韦、更昔洛韦等等药物，外用干扰素凝胶、阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏等进行治疗。
如果局部的疱疹破裂可以使用预防感染的药膏，比如夫西地酸乳膏、百多邦软膏等进行治疗。对于女性生殖器疱疹，一般来讲1-2周之内是可以逐渐的结痂、干涸、痊愈的。
但是当机体免疫力下降的时候容易复发，所以一定平时要注意生活作息规律，不要过于劳累、熬夜，保持良好的生活习惯。另外饮食要清淡，不要吃过于辛辣、刺激的食物。在疱疹发作期间还要注意避免与他人接触，以免传染他人。