3个月宝宝睡觉老是摇头考虑几种原因：1、湿疹，拨开宝宝头发检查头皮有无红疹，湿疹会有瘙痒引起头部不适感，所以宝宝喜欢摇头去缓解这种不适。如果有湿疹应将宝宝头发剃掉，外涂糠酸莫米松乳膏，同时要注意卫生，枕头、被子、被单也应定期清洗。2、维生素D缺乏，婴儿对于维生素D的需求较大，如果不及时补充维生素D容易导致维生素D缺乏，影响钙质的吸收，缺钙的婴儿睡觉时容易出汗，使宝宝头皮发痒进而频繁摇头。3、耵聍也就是耳屎，如果宝宝耳朵里有耳屎，自己又挠抓不到喜欢摇头晃脑，应定期清理宝宝的耳屎。