甲氨蝶呤属于慢作用抗风湿药，具有改善风湿病情以及免疫抑制的作用。一般在用药3-4周左右，患者的关节肿痛等症状可以出现减轻和改善。甲氨蝶呤可以降低血沉、C反应蛋白等炎性指标，能够改善类风湿患者骨质侵蚀。
除了改善类风湿关节炎以外，甲氨蝶呤对脊柱关节病、难治性银屑病以及银屑病关节炎都有肯定的疗效，而且甲氨蝶呤对肌炎和皮肌炎也有一定的治疗作用。
在治疗风湿病中与糖皮质激素合用，可以减少激素的剂量，减轻激素撤药的困难。甲氨蝶呤主要的副作用是胃肠道反应，部分患者还可能会出现骨髓抑制、口炎以及肝肾功能损害等。