C反应蛋白的高低通常和疾病严重程度之间没有直接对应关系，C反应蛋白是在机体受到感染或组织损伤时，血浆中一些急剧上升的急性期反应蛋白，其激活补体和加强吞噬细胞的吞噬作用而起调理作用，清除入侵机体的病原微生物和损伤坏死、凋亡的组织细胞，在机体天然免疫过程中发挥着重要的保护作用。
C反应蛋白升高最重要的临床意义是对感染具有重要的提示作用，特别是细菌感染，会出现C反应蛋白明显升高。病毒感染一般不会出现C反应蛋白的明显升高，仅表现为轻度升高或正常。因此，C反应蛋白也可以作为感染的鉴别指标。另外，C反应蛋白升高还能见于风湿免疫系统疾病的活动期，能够监测疾病是否处于活动期。此外，在重大的应激创伤手术之后，也可能会出现C反应蛋白升高，主要是因为在此情况下人体内有组织损伤和炎症存在，会出现急性期时相的反应蛋白，从而导致C反应蛋白升高。