一般不会痛苦的，无痛肠镜使用丙泊酚进行全身麻醉，受检查者被麻醉后是没有任何意识的，不过结肠镜检查过程中会注入适当的气体来观察肠腔的情况，且为了观察病变，有可能会反复进镜观察，有时会导致肠腔内气体较多，当清醒后会出现肚子绞痛的情况，但是顺时针揉肚子将气体排出后就没有关系。总体来说无痛肠镜还是比较好的选择。