肺结节在中医来讲病因、病机常见的是热毒痰瘀蕴结于肺部而形成，所以在临床上常常选用清肺解毒、化痰、祛瘀的药物进行治疗，常见的清肺热的功效包括清肺治湿热和清肺虚热。清肺湿热的药物常用有双花、连翘、黄芩，以及鱼腥草、紫花地丁、蒲公英等。
养阴润肺的清肺虚热药物包括百合、生地、沙参、麦冬、地骨皮等，还有活血化瘀的药物，比如三棱、莪术、全蝎、水蛭、地龙等，还包括化痰药物，常用的有杏仁、冬花、半夏、瓜蒌子等。另外夏枯草、白花蛇舌草、半枝莲，也是常用来治疗肺结节的清热散结药物。