颈内静脉血栓给予抗凝治疗即可，因为颈内静脉血栓不会有明显的临床症状，偶有同侧的脸部以及颈部的肿胀。对于颈内静脉血栓，一定要明确是什么原因导致的。
临床上最常见的是颈内静脉置管而导致颈内静脉血栓，如果没有此原因，就要除外是否存在肿瘤的因素。同时要明确是否上腔静脉也存在血栓，是否存在着纵隔内肿瘤，以及肺癌等恶性肿瘤病因的存在。
如果上腔静脉内存在血栓要给予对症治疗，颈内静脉血栓给予抗凝治疗3个月以上，即可以大部分血栓再通，甚至消失。同时颈内静脉血栓如果证实有上腔静脉血栓同时存在，就要警惕是否有肺栓塞的风险，必要时可以进行上腔静脉滤器植入术。