首先要明确引起全身器官衰竭的原因，给予积极的治疗原发疾病。同时应该分系统的治疗，如果是因为呼吸系统的疾病可以先给予保护肺脏改善通气，确保全身的氧合，如果是因为肝脏的疾病，应该给予保护肝脏，补充氨基酸，补充热量，补充蛋白，如果是因为循环系统引起的多器官功能衰竭，应该给予补充充足的血容量，维持心脏的功能，维持正常的循环状态，对于肾脏疾病引起的全身器官衰竭，首先应该保护肾脏功能，必要时候给予利尿，甚至进行血液净化治疗。