最常见是感染，大多数是病毒感染，少数是重症的细菌或真菌等，感染引起的中性粒细胞低可自行恢复。其次是受到物理、化学等因素影响，比如电离辐射、化疗药物等，需脱离相关环境才能恢复。然后就是血液系统疾病，包括骨髓衰竭性疾病，比如再生障碍性贫血、范可尼贫血、先天性角化不良、先天性中性粒细胞缺乏等等，还包括肿瘤性疾病，比如白血病、骨髓增生异常综合征、实体瘤等等。