对于慢性咽炎引发的舌根滤泡增生，最主要的治疗方向是积极治疗原发病。慢性咽炎主要是反复炎症刺激，或者是不良饮食因素刺激所导致，常见治疗如下：
1、药物治疗：平时可以选择具有清热解毒、清咽润喉的中成药制剂治疗，可以用金银花、胖大海或罗汉果等泡水喝，其本身具有消炎杀菌的功效。当然，在症状发作时也可以选择中成药制剂，如慢严舒柠、咽炎片，严重者也可以适当加用抗生素，比如罗红霉素或头孢克肟等。此外，也可以选择雾化吸入的方法缓解，比如使用吸入用布地奈德混悬液。患者一定要注意口腔的清洁和卫生，可以用生理盐水或复方氯己定、康复新液等漱口液漱口。
2、其他治疗：注意合理饮食，最好清淡饮食，忌食辛辣刺激性食物。如果舌后根淋巴滤泡比较明显，而且出现异物感，也可以采取激光手术、冷冻等方法治疗。