免疫组化是病理科经常会做的检查，它的主要作用就是进行肿瘤的诊断以及鉴别诊断，还有对肿瘤进行更为细化的分类。因为在常规的肿瘤病理诊断里面，有大概5%-10%的病例单靠传统的HE染色技术，很难做出明确的形态学诊断，在加做了免疫组化以后，特别是一些低分化或未分化的肿瘤，它诊断的准确率可以达到50%-75%。
具体来说，免疫组化在临床上的主要作用包括了许多方面，比如恶性肿瘤的诊断与鉴别诊断，确定转移性恶性肿瘤的原发部位，以及对某些肿瘤行进一步的病理分类等，所以免疫组化可以辅助病理科更好的进行肿瘤的诊断与鉴别诊断，来为临床提供治疗方案的选择。