新生儿室间隔缺损能不能自愈，要根据室间隔缺损的大小而定。
一般缺损如果在6mm以下，随着新生儿日龄或年龄的增加，缺损会逐渐的自愈，就需要每3-6个月定期复查心脏彩超来动态观察看缺损的大小有何变化。
如果缺损超过6mm，或者是室间隔缺损伴发有其他的畸形，如法洛氏四联症伴有主动脉骑跨等，其自愈的可能性就非常小。
这时在一定的时间段内，尤其是超过一岁之后缺损还超过6mm，可能就没有自愈的机会，可以进行心内科的介入治疗来关闭缺损缺口。