女性乳房发育不良大部分和青春期内分泌障碍有关，例如雌性激素分泌不足，导致乳腺腺叶和腺泡发育不良。或者发育期营养不良导致乳房发育迟缓。有些乳房基本无发育迹象，可能和遗传因素有关。而青春期的内分泌紊乱引起的发育不良，可能是性腺发育不良，或先天性卵巢发育不良引起。这部分患者女性特征不明显，而且月经也会有异常，或者出现闭经的情况。