小儿脑炎的后遗症，主要与小儿脑炎影响到中枢神经系统的具体部位有很大的关系，小儿脑炎在儿童时期是比较常见的中枢神经系统感染。如果小儿脑炎影响到了双侧额叶等高级神经中枢，有可能造成智力水平低下，包括记忆力、定向力、计算力和判断力受到影响。如果影响到了运动中枢，有可能会出现肢体偏瘫或者出现相应的颅神经麻痹。如果炎性物质特别多，堵塞上矢状窦的蛛网膜颗粒，还有可能会造成交通性脑积水，假如颞叶病变比较严重有可能会造成反复的癫痫发作。