输精管结扎术从理论上讲，并不影响性功能，因为既没有损伤到神经、血管，也没有造成体内激素水平发生改变。在实际工作中，有个别人术后确实发生了性功能障碍，主要是由于心理因素和继发于手术以后的其他并发症，其原因主要包括以下两大方面：
第一、手术相关因素，比如术前对输精管绝育术与性功能之间的关系，缺乏正确的认识而引起心理障碍。术后害怕发生性功能障碍，而过早的进行试探性性生活，结果由于手术局部疼痛或不适，加上精神紧张，容易发生性生活失败。术后轻微疼痛的症状，以及与手术无关的性功能生理性波动，被误认为是手术引起的性功能障碍。继发于手术后的痛性结节、附睾淤积症、慢性生殖道炎症，有时也会影响性生活的表现。
第二、其他的因素，比如血管性疾病、内分泌性疾病，以及其他全身慢性疾病的合并症影响了性功能，而性功能因为年龄因素发生的生理性衰竭，以及一部分本来性功能障碍就是原因不明的人，这些都会干扰到性功能。